(1) Biyogüvenlik yönetim sistemi aşağıdaki hususları içeren ve bu hususların planlanması, uygulanması, sorumluların belirlenmesi, denetlenmesi ve doğrulanması, izlenmesine yönelik düzeltici ve önleyici faaliyetlerin bütünüdür. Biyogüvenlik yönetim sistemine ilişkin hususlar şunlardır:
a) Hastalıkların kontrolü ve önlenmesi için iyi hayvan hijyen uygulamaları kapsanır.
b) Bölüm içerisinde yer alan işletmeler arasındaki giriş ve çıkışları içeren izlenebilirlik sistemi oluşturulur ve söz konusu izlenebilirlik belgelenir ve bu sistemin denetim ekiplerince kontrol edilebilir şekilde olması sağlanır.
c) Bu sistemin içerisinde biyogüvenlik planı ve yönetim sisteminin olması gerekir.
(2) Biyogüvenlik yönetim sistemi altındaki biyogüvenlik planları aşağıdaki hususları içeren, tüm biyogüvenlik tedbirleri ile survey aktiviteleri ve izlenebilirlik sistemini garanti eden ve ülke veya bölgede bölümün tanımlandığı hastalık mihrakının görülmesi gibi artan risk durumlarına karşı güncellenebilir önlemlerin bütünüdür. Biyogüvenlik planlarına ilişkin hususlar şunlardır:
a) Personel için hijyen planının uygulama sistemi belgesinin, genel ve özel hijyen uygulamaları, kalıcı ve geçici personelin eğitimi ve kontrolünü gösterir belge olması gerekir.
b) Personelin bölüm içinde ya da dışında, bölüm içerisinde beslenen aynı türden hayvanlar beslememesi veya yakın temasta olmaması ya da sertifika kapsamındaki hastalıklara karşı hassas hayvanlarla temas içinde olmaması sağlanır.
c) Bölüm içerisinde yer alan işletmeler etrafında yer alan çit, engel, kilitli kapılar gibi fiziksel bariyerler ile bina planlarında biyogüvenlik dikkate alınarak binalara giriş yerleri tanımlanır ve bu giriş çıkışlar biyogüvenlik seviyesine göre sınıflandırılarak renk kodlarıyla şemalandırılır. Tanımlanan yerler dışında binalara giriş/çıkış noktaları olmaması gerekir.
ç) Renk kodları ile şemalandırılan yerlere giriş için yetkili ve yetkisiz kişiler belirlenir, yetkisiz kişilerin girişleri engellenir veya bir plan çerçevesinde girişlerine müsaade edilir.
d) Bölüme gelen ziyaretçilerin, bölümde beslenen aynı türden hayvanlarla veya sertifika düzenlenen hastalığa karşı hassas olan hayvanlarla son kırksekiz saat içerisinde temas etmemiş olmaları gerekir. Riske bağlı olarak enfekte olmuş veya şüpheli bir bölgeden gelen ziyaretçiler için ilgili hastalığa göre çıkarılan uygulama talimatında belirtilen süre uygulanır.
e) Her ne sebeple olursa olsun işletmeye giren tüm araçların hareketlerini düzenleyen bir planın olması gerekir ve bu plan içerisinde özel, tedarik ve dağıtım araçlarıda dahil tüm araç hareketleri kaydedilir.
f) İşletme içerisine, dışına veya işletme içerisindeki tüm hareketlerin takip edilmesini sağlayan girdi ve çıktıları da içeren hayvan ve ürün izlenebilirlik sistemine yönelik kayıtların bulunması gerekir.
g) Bulaşmayı önlemek için paketleme materyali, altlık materyali, yem, su, ölü hayvan ve gübre gibi unsurların tedarik, taşıma, depolama ve dağıtımında dezenfeksiyon, uygun depolanma, imha, bekletme süresi gibi bilgileri içeren uygulama talimatları bulundurulur.
ğ) Bölüm içerisinde kullanılan ekipman ve materyallerin temizlik ve dezenfeksiyon planı ile araçların temizlik ve dezenfeksiyonu ile ilgili uygulama talimatları bulundurulur.
h) İşletmelerde yabani hayvan, kemirici ve böcekler gibi zararlılara karşı fiziksel bariyerler ve diğer tedbirleri içeren zararlı kontrol planının bulunması gerekir.
ı) İzleme yöntemleri, doğrulama, düzeltici faaliyetler ve kayıtlar gibi adımları takip eden biyogüvenlik ve yönetim sisteminin;
1) Üretime ait tüm veriler ile belirlenmiş dönemlere ait hastalanma ve ölüm oranı, kullanılan ilaçlar, doğan hayvanlar, yem ve su tüketimi ile ilgili kayıtları,
2) Aktif ve pasif survey ile tarama analizleri için numune alma planları ile numune alma sıklığı, metotları ve sonuçları ile ilgili bilgileri,
3) Tüm ziyaretçileri izleyebilmek ve gerektiğinde temas kurabilmek üzere işletmeye gelen ziyaretçilerin kayıt ve bilgileri,
4) Kullanılan aşı ile ilgili detay bilgi uygulama tarihleri ile aşılama programları ile ilgili bilgileri,
5) Bölüm içerisindeki işletmelerde çalışan tüm personelin, biyogüvenlik tedbirleri ve yönetim uygulamaları konusunda eğitildiğini gösteren belgeleri,
6) Artan risk durumlarına karşı alınacak önlemleri de içeren uygulamaları,
kapsaması gerekir.