(1) Kontrolörlerin görev ve yetkileri şunlardır:
a) Yapılan görevlendirme üzerine, Genel Müdürlük teşkilat ve görev alanına giren veya Bakanlık Makamınca Kontrolörlerce yürütülmesi uygun görülen; teftiş, denetim, soruşturma ve inceleme işlerini yapmak.
b) Genel Müdürlüğe bağlı birimlerin ve saymanlıkların işlemlerini kanun, Cumhurbaşkanlığı kararnamesi, yönetmelik ve ilgili diğer mevzuat hükümlerine uygunluğu yönünden teftiş etmek.
c) Saymanlıkların ve kurumların hesap ve işlemlerini merkezde veya yerinde incelemek ve denetlemek.
ç) Kamu idarelerine bağlı döner sermayeli işletmelerin işlemlerinin, bütçe ve harcama ilkelerine ve ilgili mevzuat hükümlerine uygunluğunu, bu idarelerce gayri safi hasılat üzerinden genel bütçeye aktarılması gereken tutarların doğruluğunu, vergi mükellefiyet ve sorumluluğu ile diğer kanuni kesintilere ilişkin yükümlülüklerin tam ve zamanında yerine getirilip getirilmediğini denetlemek.
d) Mevzuatı uyarınca genel bütçeye aktarılması gereken paylar ile gelir fazlalarının doğru hesaplanıp hesaplanmadığını ve usulüne uygun olarak ilgili hesaplara aktarılıp aktarılmadığını denetlemek.
e) Mevzuatı uyarınca ilgili kamu kurum ve kuruluşlarına yapılan Hazine yardımlarının belirlenen esaslar çerçevesinde ve amacına uygun olarak kullanılıp kullanılmadığını denetlemek.
f) Kamu kurum ve kuruluşlarınca işletilen eğitim ve dinlenme tesisi, misafirhane, çocuk bakımevi, kreş, spor tesisi ve benzeri sosyal tesislerin hesaplarını incelemek ve denetlemek.
g) Genel Müdürlükçe derlenen mali istatistiklerin kalitesini arttırmak amacıyla genel yönetim sektörü kapsamındaki idarelerin muhasebe işlemlerinin ve hazırlanan mali tablolarının ilgili mevzuatı ile genel kabul görmüş uluslararası muhasebe ilkelerine uygunluğunu denetlemek.
ğ) Elçilik ve konsolosluk nezdindeki mali iş ve işlemleri incelemek ve denetlemek.
h) Suç sayılan eylem ve işlemleri görülenler hakkında 19/4/1990 tarihli ve 3628 sayılı Mal Bildiriminde Bulunulması, Rüşvet ve Yolsuzluklarla Mücadele Kanununa göre soruşturma yapmak.
ı) Yetkili merciler tarafından görevlendirilmeleri halinde 2/12/1999 tarihli ve 4483 sayılı Memurlar ve Diğer Kamu Görevlilerinin Yargılanması Hakkında Kanuna göre ön inceleme yapmak.
i) Disipline aykırı fiil ve halleri görülenler hakkında alınan onaya istinaden disiplin soruşturması yapmak.
j) Teftiş edilen birimlerin amirleri ve gerekli görülen memurları hakkında şekli ve içeriği Genel Müdürlükçe belirlenecek personel değerlendirme belgesi düzenlemek.
k) Refakatlerine verilen Stajyer Muhasebat Kontrolörlerinin ve Muhasebe Denetmen Yardımcılarının meslekte yetişmelerini sağlamak.
l) Yapılan görevlendirme üzerine yurt içinde ve yurt dışında araştırmalar yapmak, görevlendirildikleri komisyon, kurs, seminer, toplantı ve eğitim programlarına katılmak.
m) Yürürlükteki mevzuat ve uygulamalarda görülen noksanlıklar ile bunların düzeltilme yöntem ve usulleriyle ilgili görüş ve önerilerde bulunmak.
n) Bakanlık Makamı, Genel Müdür veya Başkan tarafından verilen diğer görevleri yapmak.
(2) Birinci fıkrada belirtilen görevler usulüne uygun görevlendirme yapılmadıkça, Kontrolörlerce resen yapılamaz. Kontrolörler görevlerine ilişkin çalışmaları neticesinde düzenleyecekleri rapor veya yazıları Başkanlığa intikal ettirirler.
(3) Kontrolörler görevlendirildikleri teftiş, denetim, soruşturma ve incelemeler kapsamında tüm resmi daire, kurum ve kuruluşlar ve kamuya yararlı dernekler, meslek kuruluşları, bankalar ile diğer gerçek ve tüzel kişilerden gizli de olsa bütün defter, dosya ve belgeleri istemeye, incelemeye ve gerektiğinde zimmet karşılığında almaya yetkilidir.