Serbest Bölgeler Kanununun 7 inci maddesi uyarınca kurulan "Serbest Bölgeleri Tesis ve Geliştirme Fonu"na İstanbul Atatürk Hava Limanı Serbest Bölgesi Kıyı Bankacılığı Merkeziyle ilgili olarak tüm ödemelerin yapılabilmesi için, Türkiye Cumhuriyet Merkez Bankası nezdinde, İstanbul Kıyı Bankacılığı hesabı açılır.
Fona yapılacak ödemeler şunlardır:
a) Bankaların Türkiye'de mukim gerçek ve tüzel kişilere verdikleri nakdi krediler nedeniyle nakden ve hesaben kendi lehlerine aldıkları paralardan yüzde 5 oranında ve takip eden 90 gün içinde yatırılan kesintilerdir.
b) Bankalar tarafından DPT Müsteşarlığı Serbest Bölgeler Başkanlığından alınan "Faaliyet Ruhsatı" karşılığı olmak üzere 50.000.- ABD Doları veya eşdeğeri konvertıbl döviz olarak ödenen "Faaliyet Ruhsatı Yıllık Ücreti" dir.
Fon'a yapılacak bu ödemeler T.C. Merkez Bankasındaki İstanbul Kıyı Bankacılığı hesabına yapılır ve karşılığında verilecek makbuzlarda, ödemeyi yapan, ödeme miktarı ve cinsi belirtilir.
Bölge Müdürlüğü, her mali yıl başından önce, bir sonraki yıl için yapılacak harcamaları kapsayan program teklifini DPT Müsteşarlığı'na intikal ettirir. DPT Müsteşarlığı Serbest Bölgeler Başkanlığınca, Bölge Müdürlüğünün bu teklifi de gözönünde tutularak, fon kullanımlarını belirleyen bir sonraki yıl finansman programı hazırlanarak, Başbakanın veya görevlendireceği Devlet Bakanının onayı ile yürürlüğe konulur. Fon kalemlerinde değişiklik, tekrar onay gerktirir.
DPT Müsteşarlığı, Serbest Bölgeler Başkanlığı, diğer tali hesaplar açılması için, Türkiye Cumhuriyet Bankası Başkanlığına talimat verebilir.
Bölge Müdürü, Fom'la ilgili harcamaları yapar, yıllık ve hastalık izinleri sebebiyle görevinde bulunmadığı zamanlarda bu yetkiyi kendisine vekalet edecek göreviyle devreder. İmza sirküleri, DPT Müsteşarlığınca hazırlanarak bankaya bildirilir.