Başkan, müfettiş sıfat ve yetkisine haiz olup, aşağıdaki görevleri yapar;
a) Kurulun 5 inci maddede belirtilen görevlerini yürütmek,
b) Kurulu yönetmek, müfettişlerin çalışmalarını düzenlemek ve denetlemek,
c) Gerektiğinde bizzat, teftiş, inceleme, araştırma ve soruşturma yapmak,
d) Genel Müdürün teftiş, denetleme, inceleme, araştırma ve soruşturma emirleri üzerine müfettişleri görevlendirmek ve emirlerin uygulanışını izlemek,
e) (Değişik: RG-14/11/2002-24936) Müfettişlerden gelen raporları incelemek, eksiklerin giderilmesini sağlamak ve yetkili ya da ilgili mercilere göndermek, ilgililerce alınacak tedbirler ve yapılacak işlemlerle ilgili tekliflerde bulunmak,
f) Müfettiş yardımcılarının işe alınması ve 3 yıllık staj döneminde yetişmelerini sağlayıcı tedbirleri almak, müfettiş yardımcılığı giriş sınavı ile müfettişlik yeterlik sınavının yapılmasını ve yürütülmesini sağlamak,
g) Teftiş programlarını hazırlamak ve Genel Müdürün onayına sunmak, onaylanmış teftiş programlarının uygulanmasını sağlamak, uygulama sırasında doğacak güçlük ve aksaklıkların giderilmesi için gerekli tedbirleri almak,
h) Müfettişlerin bilgi, görgü ve yeteneklerinin artırılması, teftiş metodlarının geliştirilmesi, modern sevk ve idare, yöneticilik, idare ile ilgili yeni uygulama ve hizmetlerin tanıtılması amacı ile kurslar, seminerler, konferanslar, yabancı ülkelerde inceleme ve araştırmalara ait hizmet içi eğitim programlarının düzenlenmesini ve uygulanmasını sağlamak,
ı) Üyesi olduğu kurul ve komisyonların toplantılarına katılmak,
j) Müfettişlerin özlük işlemlerini izlemek, bu konularda Genel Müdüre teklifte bulunmak, müfettişlerin çalışma ve hakediş çizelgelerini incelemek, müfettiş istihkaklarını tahakkuk amiri sıfatıyla onaylamak ve gerekli işlemlerini yapmak,
k) Kurulun çalışmalarına ait yıllık genel durum raporunu düzenlemek ve Genel Müdüre sunmak,
l) Mevzuatın, müfettişler tarafından değişik yorumlanması hallerinde, görüş ve uygulama birliğinin sağlanması için gerekli tedbirleri almak,
m) Teftiş, inceleme ve soruşturmalarının yürütülmesinde uygulama birliği ve esaslarını belirleyen teftiş rehberi ve Başkanlık talimatı hazırlamak ve uygulanmasını sağlamak,
n) Müfettişlerin mesleki ve ilmi çalışmalarını teşvik ve tanzim etmek, gerekirse başarılı inceleme sonuçlarının yayımlanmasını sağlamak,
o) Mevzuatta yer alan veya Genel Müdürce verilen benzeri görevleri yapmak.
Başkan kendisine verilen ve Başkanlığa ait görevlerin yerine getirilmesinden, yürürlükteki mevzuat çerçevesinde sorumludur.